头顶有小脓包通常是毛囊炎、疖、过敏性皮炎等原因引起的，需根据具体病情选择药物治疗。具体分析如下：
1、毛囊炎
头顶部位的毛囊发生细菌感染时，由于局部炎症刺激，会出现红色的硬疙瘩，伴有瘙痒、触痛等症状，严重时表面会出现较小的脓头，通常和细菌感染有关。患者可以遵医嘱局部使用红霉素乳膏、莫匹罗星软膏等药物来进行治疗。
2、疖
疖通常是局部毛囊部位出现化脓性炎症病变所致，患者的皮肤表面会出现红疹，顶端有黄色的脓头，伴有疼痛、渗出等症状。患者此时应该遵医嘱局部使用盐酸金霉素软膏、夫西地酸乳膏等药物来进行治疗。
3、痤疮
通常和头部皮脂分泌旺盛、痤疮丙酸杆菌感染等有关，会导致患者皮肤表面出现黑头或者白头，伴有轻微瘙痒、渗出等症状。建议患者在医生的指导下服用异维A酸软胶囊、复方珍珠暗疮片等药物来改善症状。
除上述常见原因外，还有可能是其他因素所致，比如脂溢性皮炎、脓疱型银屑病、头癣等，患者此时需要及时就医治疗，以免耽误病情。
