12岁月经一个月来两次，可能是生理因素，也可能是病理因素，如排卵功能障碍、子宫出血等，可以选择一般治疗、药物治疗、手术治疗。具体分析如下：
一、生理因素
12岁的女孩处在青春期发育期间，由于体内的雌孕激素水平没有形成规律性，可能就容易扰乱正常的月经周期，这是属于正常生理现象，不需要特殊治疗，月经周期会随着孩子的增长而变化。
二、病理因素
1、排卵功能障碍
如果12岁女孩卵巢功能排卵障碍，也可能会造成月经不规律，主要由于体内激素水平发生改变而引起。可以通过饮食调整，尽量多吃鸡蛋、花生、核桃等食物，有助于排卵功能的调理。也可以在医生指导下口服枸橼酸克罗米芬胶囊、黄体酮、戊酸雌二醇片等。
2、子宫出血
可能是功能失调性子宫出血，主要由于雌激素水平短暂下降，使子宫内膜失去激素的支持，会出现部分子宫内膜脱落引发阴道出血。可以在医生指导下口服屈螺酮炔雌醇片、炔雌醇环丙孕酮片、去氧孕烯炔雌醇片等药物治疗。
除了以上原因外，还可能是子宫肌瘤等疾病而引起，需尽快去医院妇科就诊，进一步检查明确病因，可以通过手术治疗。
