一般情况下，起床后左肩胛骨疼是肩周炎、颈椎病变、肩袖损伤等引起的。具体分析如下：
1、肩周炎
肩周炎是肩部疼痛的常见原因之一，是由于肩部肌肉和肩胛骨周围的组织受到炎症或损伤引起的。患者可在医生建议下短期服用非甾体抗炎药缓解疼痛。常用药物包括布洛芬缓释片、依托考昔片等。
2、颈椎病变
颈椎病变可能会引起肩胛骨疼痛，尤其是在早上起床时。患者表现为左侧肩胛骨处疼痛，并伴有左侧上肢疼痛麻木或无力表现。患者可以到医院选择颈部牵引、理疗、针灸的方式治疗。
3、肩袖损伤
肩袖是肩部肌肉和肌腱的组合，如果肩袖受到损伤，可能会引起肩胛骨疼痛。如果疼痛感严重，建议患者及时到正规医院进行针灸、拔罐的方式进行缓解。
除此以外，还可能是风湿性关节炎、颈神经根痛等引起的。建议患者出现上述症状后，及时到正规医院根据医生建议选择合适的方式进行治疗，避免情况严重化。
