高压氧虽然在临床已经广泛运用，但也有局限性，根据2018年中华医学会高压氧医学分会制定的高压氧的禁忌证规定以下情况下不适合做：
1、绝对禁忌症：未经处理的气胸、同时服用双硫仑药物的、同时服用抗肿瘤药物如博莱霉素、阿霉素、顺铂的，早产和（或）极低体重新生儿。
2、相对禁忌症，也就是相对不安全因素，包括胸部外科手术围手术期、中耳手术围手术期、呼吸道传染性病毒感染、未控制的癫痫、高热、幽闭恐惧症、颅底骨折伴脑脊液漏、先天球形红细胞症、未控制的高血压等，其中妊娠3个月以内不建议连续多次高压氧治疗，必须需要高压氧治疗除外。
另外，重度肺气肿、肺大泡、血压过高、心率低于50次/分、心脏二度房室传导阻滞、视网膜剥离患者、活动性出血等疾病也需要医生额外关注，需要高压氧科专业医生根据病人情况综合考虑判断是否可以做高压氧。
比如血压过高病人，临床上有些病人，因为脑梗血压没办法降到很低，会影响血流供应。比如基础血压比较高，本身有160mmHg、170mmHg以上，也要客观评估，比如病人今天血压165mmHg，舒张压是105mmHg，病人没有自觉症状，没有头晕、头痛，本身已经吃降压药，这种病人如果临床需要也可以进舱治疗，这时在治疗过程中要注意密切观察病情，遇到病人不舒服要马上处理。
还有经常晚上急诊时，因为一氧化碳中毒，病人是在洗澡过程中，冬天天气很冷，脱衣服后经常会有轻度感冒症状，这种情况为救命高压氧一定要做，过程中建议病人多做捏鼻鼓气、吞口水动作，然后加压速度尽量放慢。在进舱前可以考虑滴1%麻黄素收缩鼻腔血管。这种情况也可以做，不是一概而论。
