亚低温治疗的并发症有肺部感染、循环系统并发症、电解质紊乱等症状。
1、肺部感染
亚低温治疗降低了机体的体温，使全身的基础代谢处于低温状态，影响了体内各系统功能的正常发挥，易引起肺部感染的发生。
2、循环系统并发症
主要是低血压及心律失常。镇静药氯丙嗪具有扩张血管及降血压的作用，易引起循环不稳及体位性低血压。
3、电解质紊乱
常见的就是低钾血症，冷利尿导致电解质丢失，容易引起电解质紊乱，包括低钾、低镁和低磷酸盐，低温诱导期发生率最高，需严密监测。
亚低温治疗的并发症还有会出现冻疮，建议亚低温治疗的患者需要密切观察，提前预防。
