新生儿败血症的并发症包括胆红素脑病、化脓性脑膜炎、感染性休克、凝血功能障碍、全身多个脏器功能障碍。
1、胆红素脑病
新生儿败血症会导致红细胞溶血，造成病理性黄疸的发生，严重时可导致胆红素脑病的发生，会有嗜睡及肌张力减弱、吸吮力减弱等症状。
2、化脓性脑膜炎
细菌不断感染，得不到控制，会感染到中枢神经系统，导致化脓性脑膜炎的发生，出现恶心、呕吐、食欲下降及腹胀、发热等症状。
3、感染性休克
新生儿血压会不断降低，皮肤褶皱多，严重时会造成甚至昏迷，甚至会导致感染性休克，威胁到新生儿的生命。
4、凝血功能障碍
败血症会引起新生儿凝血功能受到障碍，皮肤容易出血，受外力轻轻挤压，也会有淤青及血肿的症状，出血后止血比较困难，容易因失血过多造成贫血。
5、全身多个脏器功能障碍
细菌感染到全身，会出现全身症状，多处器官的功能受到障碍，比较常见的是累及呼吸系统，出现肺炎及肺脓肿等症状。
