发烧39.6度一般指的是发热39.6℃，宝宝发热39.6℃一般是消化不良、上呼吸道感染、支气管炎、尿道炎、肺炎等因素引起的，需要对症治疗，所以不存在最佳处理方法的说法，具体分析如下：
1、消化不良
这一般是进食过多，导致过多的食物在肠道内堆积造成。可以遵医嘱使用多潘立酮片、健胃消食片、西沙必利片等药物，促进胃动力，改善不良症状。
2、上呼吸道感染
这通常是病毒和细菌感染引起的，通常伴随有流感、咳嗽和鼻塞等症状。患者可遵医嘱服用阿奇霉素胶囊、盐酸莫西沙星片等药物改善不良症状。
3、支气管炎
如果是病毒感染引起支气管炎，炎症因子对机体造成刺激导致的。可以在医生的建议下使用大环内酯类的抗生素进行治疗，比如阿奇霉素分散片、罗红霉素分散片、克拉霉素胶囊等，改善不良症状。
4、尿道炎
如果是出现尿道炎，通常是不注意卫生、抵抗力下降等，导致病原菌通过尿道口进入尿道内引起的。可以在医生的指导下使用头孢类的抗生素治疗，常用的药物有头孢克肟颗粒、头孢氨苄颗粒、头孢克洛颗粒等，能够起到抗感染的作用。
5、肺炎
肺炎是肺部感染的一种，可能导致发热、咳嗽、呼吸急促等症状。患者可遵医嘱服用盐酸氨溴索分散片、盐酸溴己新片等药物治疗。
除此以外，还可能是病毒性心肌炎导致的。建议及时就诊，明确诊断后采取合理的治疗。
