香菇在烹饪中运用较广，适于卤、拌、炝、炒、炖、烧、炸、煎等多种烹法。既可作主料，也可作多种原料的配料，还可用于馅心的制作，有时还有配色的作用。
香菇中膳食纤维，丰富100克可食用的部分，含有7%左右的粗纤维，膳食纤维有促进肠胃蠕动，改善便秘的作用，但是却很难消化，需要在胃中后停留很长一段时间才能消化完全，对于本身脾胃虚弱，消化不好的人来说，吃香菇会加重其肠胃负担，所以不宜食用。
香菇是发物，有动风之效，体内脾胃虚寒，寒气重，湿气重的人不宜食用，因为吃香菇只会让体内这些湿气寒气变得更严重，所以不宜吃。
孕妇生产之后，体质虚寒，宜吃温补的食物，香菇虽然性平，但是它的性质还是偏寒凉的，所以刚生产完的妇女不宜食用香菇。
其实大多数菌类中的嘌呤含量属于中高型，嘌呤食物吃多会加重痛风，但是香菇在干制、储存与烹调过程中，其中的嘌呤受到一定影响，痛风患者可以少量食用。但所谓的蘑菇浓汤、三鲜汤等不适宜吃。
医学资料上面显示患有高血压的病人是可以吃香菇的。香菇有一定的降低血压的效果的。
香菇中的脂肪以不饱和脂肪酸为主,且80%以上是亚油酸,它是香菇降压、降脂、防治动脉粥样硬化的重要物质。香菇中含有的香菇嘌呤等核酸物质能促进胆固醇的分解和排泄,连续食用能降低胆固醇及三酰甘油。另外,香菇属高钾低钠食品,对稳定、降低血压,保护血管也十分有益。因此,高血压、动脉粥样硬化、年老体弱及肿瘤等患者,宜常食香菇。
香菇若是和河蟹一起食用容易导致肾结石。香菇和河蟹当中都富含维生素D，一起吃会导致含量过高，钙物质增加，导致结石。香菇若是和河蟹一起食用容易导致肾结石
香菇不能和西红柿和胡萝卜一起吃，香菇中生化物质含量丰富，与富含类胡萝卜素丰富的西红柿、胡萝卜等食物同食，会破坏西红柿的类胡萝卜素，使其营养价值降低。
香菇和驴肉一起容易导致腹痛腹泻。驴肉是高蛋白低脂肪食物，可以补气血，益脏腑。香菇是发物，一起吃容易加重肠胃负担。
鹌鹑蛋是不能和香菇一起食用的，当鹌鹑蛋和香菇一起食用时会产生一种物质，这种物质容易使食用者的面部生长黑斑，不利于皮肤健康，所以说，我们一般不建议香菇和鹌鹑蛋一起食用。
香菇不宜与鹌鹑肉同食，否则可能会使人体产生血管痉挛。
