目前，隐睾的确切机制尚不完全搞清楚，隐睾病因学有那么几种：
第一大类是内分泌学说，包括有下丘脑-垂体-睾丸轴失衡、睾丸分化异常、雄激素、抗Muller管激素缺乏均可以引起隐睾。
第二点是遗传因素，有些患者呐，是存在家族性隐睾，另外常染色体和性染色体的异常也可以引起隐睾的发生。第三点呐是解剖因素，主要有睾丸引带缺如，睾丸引带呐是一个重要的组织器官，它呐通过牵拉睾丸，可以将睾丸呐从腹腔内下降到阴囊里，当它嵌入的时候呐，就会出现隐睾。
另外鞘状突未闭，还有呐是腹股沟发育异常，包括内环过小或阴囊口有机械性梗阻，还有呐，精索血管和输精管过短也可以导致隐睾。
睾丸本身发育缺陷也是一个原因，有些病例呐是在睾丸本身的缺陷，如睾丸在宫内扭转后萎缩，仅存在精索血管和输精管残端、睾丸与附睾分离、附睾缺如等先天性缺陷均可以导致睾丸下降异常。
