甲亢和甲减属于两种疾病，引起甲亢和甲减的原因也不同。甲亢通常是遗传、长期使用某些药物、垂体瘤等原因引起的。甲减一般是甲状腺破坏、自身免疫损伤或服用抗甲状腺药物等原因导致的。
甲亢具有遗传倾向，如果有甲亢家族史，患甲亢的几率一般就比较大。如果长期使用含碘造影剂、胺碘酮或干扰素等药物，也可能会引起甲亢。若患有垂体瘤，通常会分泌过多的促甲状腺激素，从而使甲状腺大量分泌甲状腺激素，引起甲亢。
如果做甲状腺次全切等甲状腺手术，通常会破坏甲状腺，影响甲状腺功能，可能会导致甲减。如果出现自身免疫损伤，比如产后甲状腺炎、萎缩性甲状腺炎或桥本甲状腺炎等，通常会导致甲状腺激素合成、分泌过少，引起甲减。若服用硫脲类、锂盐等抗甲状腺药物，使甲状腺激素合成受到影响时，通常也可能会引起甲减。
