甲状腺功能偏低的原因有：自身免疫性疾病、药物、手术等造成的甲状腺产生激素过少或者甲状腺激素利用障碍而导致的低代谢性疾病。具体如下：
1.自身免疫性疾病如桥本甲状腺炎、萎缩性甲状腺等，免疫系统产生了攻击甲状腺体的抗体，使得甲状腺部分滤泡细胞被破坏，导致甲状腺激素分泌不足出现甲状腺功能低下，如果患者无明显症状，可以观察随访，如果合并临床甲减，可以服用甲状腺素片治疗。
2.药物：治疗甲状腺功能亢进的硫脲类药物，治疗肝炎的干扰素，还有一些治疗精神疾病的药物如锂盐，还有胺碘酮等药物会引起甲状腺功能减低，因此在使用上述药物时要在医生指导下使用，用药期间，定期复查甲状腺功能，出现甲低时及时处理。
3.手术：例如甲状腺手术、放射性碘治疗、颈部放疗等都有可能会导致甲状腺功能低下，症状严重时可能需要终身服用甲状腺素进行替代治疗。
另外一些垂体疾病如垂体瘤等以及先天性甲减、先天性甲状腺缺如等因素也会造成甲状腺功能偏低。因此如果出现甲低症状，需要及时到正规医院内分泌就诊，及时查明病因。
