吃了奇亚籽拉肚子可能是正常的生理性现象，也可能是慢性胃炎、过敏性胃肠炎等疾病引起的病理性现象。
奇亚籽中的膳食纤维含量比较高，可以促进肠道蠕动，加快肠内容物排出，起到缓解便秘的作用。奇亚籽中还含有大量的果胶，能够润滑肠道，以及保持大便比较软。所以吃了奇亚籽拉肚子，可能是因为肠道蠕动速度比较快，引起的正常的生理现象。
吃了奇亚籽拉肚子，还可能是因为患者感染幽门螺杆菌，长期饮食比较刺激，导致胃黏膜发生慢性病变出现慢性胃炎，或患者抵抗力比较低下、为过敏性体质，容易对奇亚籽过敏，导致吃了奇亚籽以后，肠道发生变态反应，发生过敏性胃肠炎造成的。
吃了奇亚籽拉肚子，如果症状比较严重，可以在医生的指导下使用止泻药，比如蒙脱石、乙胺丁醇等抑制肠道蠕动速度，进行改善。
