随着生活水平的提高，健康问题也越来越受到人们重视，这也促使了一种新型市场模式-功能性水果的推出。日本消费者厅已允许食品进行功能性标注，想要进行标注的食品要先进行安全性评估，如果通过评估，提交的功能性申报才会被受理。申报的食品中一半左右都是水果。
日本静冈县的“三日蜜桔”已于2015年获得进行功能性标注的权利，称为第一种标注功能性的生鲜食品。这种蜜桔中含有的橙色色素“β-隐黄素”，对骨骼代谢有帮助。而受到功能性标注的水果在商店中的存在感提高很多，竞争力得到提高，相应的价格也会提高，很多消费者表示愿意接受功能性水果的价格提高。
2018年1月，日本青森县的“PrimeApple!(富士)”苹果获得功能性标注权利，同年12月“王林”也获得标注资格，这些苹果中含有多酚，有抗氧化的作用，能抑制内脏脂肪堆积。相应的，这些苹果的价格要比普通苹果高3成。
日本目前批准标注功能性的水果逐渐增多，JA全农与长野县、信州大学合作，针对该县出产的葡萄“NaganoPurple”作为功能性标注食品进行申报。该葡萄中含有一种氨基酸，有抑制血压的作用，如果能成功受理，将成为第一种可以进行功能性标注的葡萄。
