腭裂通常可根据腭部裂隙的不同程度进行分类。
不完全性腭裂：裂隙累及软腭及部分硬腭，常同时伴有单侧不完全性唇裂发生。切牙部的牙槽嵴完整无损。
单侧完全性腭裂：裂隙自悬雍垂开始直抵门齿孔，然后斜向外侧，一般在单侧切牙部位与前颌骨分离。
双侧完全性腭裂：常与双侧完全性唇裂同时发生。裂隙在侧切牙部斜向两侧，鼻中隔孤立的游离在中央。两侧腭板有时有从水平为移向垂直位的趋势，这样使裂隙增大而鼻腔缩小。
软硬腭交界处裂孔：此畸形极为少见，患者发音不清，软腭部肌肉亦有畸形。
